Начало формирования детской коллекции музеем относится к первой половине 80-х годов XX столетия. В коллекции произведений детского искусства есть работы детей Сибири: рисунки, гравюры, скульптуры, изделия декоративно-прикладного искусства, в т.ч. традиционного искусства народов Чукотки, Якутии, Тывы, Хакасии, Бурятии, Приамурья. Кроме сибирской коллекции детских произведений в музее скомплектована зарубежная коллекция, представленная рисунками детей из 33 стран мира.
В коллекции собраны произведения живописи, графики, декоративно-прикладного искусства Сибирских и Дальневосточных художников.